新成果：5小時可創(chuàng)建脂類串聯(lián)質(zhì)譜譜庫

　　該軟件被稱為LipidBlast，是由Oliver Fiehn和他的同事們在加州大學研發(fā)的。Davis去年在《Nature Methods》雜志發(fā)表了一篇論文將此軟件首次公開。LipidBlast創(chuàng)建一個特定類別脂質(zhì)的質(zhì)譜庫的步驟是：首先，分析這類脂質(zhì)中已知成員的化學結(jié)構(gòu)。然后，使用這些信息來推測具有相似結(jié)構(gòu)的此類物質(zhì)的其它可能成員。接下來，此軟件將部分已知成員的化學結(jié)構(gòu)與之前研究得到的已知成員的串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)相關(guān)聯(lián)。最后，它利用這些關(guān)系來確定含有已推測成員在內(nèi)的所有其余成員的MS/MS譜圖，包括母離子和子離子。一經(jīng)驗證，通過對比實驗數(shù)據(jù)和檢索MS/MS譜庫，得到的譜庫就可以用于鑒別LC-MS/MS分析的生物樣品中的這些物質(zhì)。

此軟件靈活性很強

　　由于脂類在串聯(lián)質(zhì)譜中容易形成可預知的碎片，所以尤其適合此軟件電腦譜庫的創(chuàng)建。而且，LipidBlast非常靈活，足以應付推測正、負離子下或不同的外加電壓下的MS/MS譜圖。在建立譜庫時，這種靈活性使得它能夠利用40種高或低分辨率質(zhì)譜儀的譜圖，包括三重四極桿質(zhì)譜儀和傅里葉變換質(zhì)譜儀。

　　Fiehn和他的同事利用LipidBlast 建立了一個基本演示MS/MS譜庫，包含212,516張譜圖，覆蓋26種脂類物質(zhì)的119,200種化合物。這些化合物包括磷脂類、甘油脂類、細菌脂聚糖類和植物糖脂類。他們已經(jīng)使用這個庫來識別了藻類、有鞭毛的原生生物和哺乳動物干細胞中的脂質(zhì)。

能應對低磷水平的脂類家族

　　最近，F(xiàn)iehn已將注意力轉(zhuǎn)移到了一類特殊的脂類−葡萄糖醛酸糖脂(glucuronosyldiacylglycerol，GlcADG)。它是近期日本科學家從植物中發(fā)現(xiàn)的一種脂類。由于GlcADG可以代替植物細胞膜上的磷脂，所以可以幫助植物應對低磷水平。雖然這種脂類首先在植物中發(fā)現(xiàn)，但它也可能出現(xiàn)在細菌、真菌和藻類等其他生物中。

　　為了與最初發(fā)現(xiàn)這類脂質(zhì)的日本科學家們一起在其它有機體中尋找這類脂質(zhì)，F(xiàn)iehn和他的一位同事使用LipidBlast創(chuàng)建了一個GlcADG類的MS/MS質(zhì)譜庫。照例，這需要利用日本科學家先前得到的MS/MS譜圖和植物中GlcADG類物質(zhì)的化學結(jié)構(gòu)，以及相似脂類成員的化學結(jié)構(gòu)。最終的譜庫包含15,000 張MS/MS譜圖，建成僅耗時5小時。

　　“這項工作不僅有希望通過GlcADG來擴展已知有機體的范圍，而且也從另一個方面體現(xiàn)了LipidBlast快速創(chuàng)建MS/MS譜庫的能力”，F(xiàn)iehn說。他們還開發(fā)了應用于新型脂類的免費模板，用來鼓勵其他研究人員使用這款軟件。